Управлением Россельхознадзора по Республике Башкортостан  администрирование доходов осуществляется в соответствии с Постановлением Правительства Российской Федерации от 29.12.2007г. № 995 «О порядке осуществления федеральными органами государственной власти (государственными органами), органами управления государственными внебюджетными фондами Российской Федерации и (или) находящимися в их ведении казенными учреждениями, а также центральным банком Российской Федерации бюджетных полномочий главных администраторов доходов бюджетов бюджетной системы Российской Федерации».
Выполнение функций администраторов доходов бюджета бюджетной системы Российской Федерации Управлением Россельхознадзора по РеспубликеБашкортостан осуществляется в соответствии с приказами Россельхознадзора от 19.08.2016г. № 599 «Об осуществлении Федеральной службой по ветеринарному и фитосанитарному надзору бюджетных полномочий главного администратора (администратора) доходов федерального бюджета, территориальными органами Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору бюджетных полномочий администраторов доходов федерального бюджета», от 19.08. 2016г. № 598 «О закреплении за территориальными органами Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору бюджетных полномочий по осуществлению функций главных администраторов доходов бюджетов субъектов Российской Федерации и местных бюджетов.
Порядок возврата Управлением сумм, излишне уплаченных денежных взысканий (штрафов), государственной пошлины и возмещение ущерба 
Для возврата излишне уплаченных денежных взысканий (штрафов), государственной пошлины и возмещения ущерба плательщики представляют в Управление заявления в письменном виде в произвольной форме о возврате излишне уплаченных денежных средств с указанием причин возврата.
Заявление должно содержать:

1. Фирменное (полное официальное) наименование плательщика (для юридических лиц), ФИО полностью (для физических лиц);
2. Номер корреспондентского счета банка плательщика;
3. БИК банка плательщика;
4. ИНН плательщика;
5. КПП плательщика (для юридических лиц);
6. Код бюджетной классификации;
7. Код Общероссийского классификатора территорий муниципальных образований (ОКТМО);
8. Причины возврата;
9. Сумму возврата прописью и цифрами (в рублях, копейках).

К заявлению о возврате излишне уплаченных денежных взысканий (штрафов), государственной пошлины и возмещения ущерба прилагаются подлинные платежные документы об уплате, при невозможности предоставления подлинных документов, предоставляются выписка из банка, копия платежного поручения, копия квитанции об оплате.