По общему правилу иски о компенсации вреда окружающей среде могут подавать уполномоченные органы государственной власти РФ, ее субъектов, органы местного самоуправления, прокурор, граждане, общественные объединения и некоммерческие организации экологического профиля. Присужденные судом суммы компенсации подлежат зачислению в бюджеты муниципальных образований и городов федерального значения.
В 2019 г. в ст. 46 БК РФ, на которую ссылается Пленум Верховного суда РФ, были внесены изменения: в п. 22 уточнены правила о зачислении компенсационных сумм за возмещение вреда, причиненного окружающей среде на особо охраняемых природных территориях. Данные суммы зачисляются в федеральный, региональный или муниципальный бюджет в зависимости от значения такой территории.