В 2019 году отделами Управления Россельхознадзора по Республике Башкортостан проведено 2952 проверки, выявлено 1507 нарушений. 
Наибольшее количество нарушений зафиксировано в части выявления несоблюдения ветеринарно-санитарных правил перевозки, хранения и реализации животноводческой продукции, ветеринарного законодательства – 507. 
441 нарушение выявлено в сфере карантина растений, контроля за качеством зерна; 307 – в сфере использования и охраны земель сельскохозяйственного назначения; 252 – в сфере семеноводства сельскохозяйственных растений.
Управлением Россельхознадзора в 2019 году составлено 1089 протоколов об административных правонарушениях, что на 11,3% меньше, чем в 2018 году. Выдано 641 предписание, на 5% больше, чем в предшествующем году. 
Управлением активно применяется выдача предостережений. В 2019 году выдано 153 предостережения, что 1,3 раза больше относительно 2018 года. Выдано 330 представлений, в 1,5 раза больше, чем в предыдущем году, рассмотрено 1153 административных дела.
Таким образом, Управлением выявлены нарушения, устранение которых позволило улучшить эпизоотическую, фитосанитарную и продовольственную безопасность республики, здоровье людей. 
За 2019 год Управлением Россельхознадзора наложено штрафов на сумму 9 млн 800 тыс. 780 рублей, что на 3 млн 880 тыс. 330 рублей больше, чем за аналогичный период прошлого года. 
Взыскание штрафов составило 87%, или 8 млн 484 тыс. 720 рублей. 
В сфере внутреннего ветеринарного надзора проведено 594 проверки.
С целью профилактики и распространения африканской чумы свиней отобрано более 2,5 тыс. проб.
В рамках эпизоотического мониторинга отобрано более 15 тыс. проб, обследовано 124 свиноводческих хозяйства по определению зоосанитарного статуса и включению их в Реестр Таможенного Союза.
Выдано 12 лицензий на осуществление фармацевтической деятельности в сфере ветеринарии, выборочно отобрано 33 пробы в рамках контроля качества лекарственных средств для ветеринарного применения.
В целях исключения оборота фальсифицированной и некачественной животноводческой продукции прекращено действие 11 деклараций, а также направлены материалы на отзыв еще пяти деклараций о соответствии. 
В Башкортостане в 2019 году зарегистрировано 15 случаев заболевания бешенством. В связи с резким ухудшением эпизоотической обстановки по заболеваемости бешенством среди животных, в республике выросла угроза распространения этой инфекции. 
В связи с этим в 2019 году вакцинацией против бешенства охвачено более 2 млн голов сельскохозяйственных животных, а также собак и кошек.
С целью обеспечения максимального охвата животных прививкой в республике объявлены дни профилактики бешенства. На данные цели из федерального бюджета выделены средства для полного охвата всего восприимчивого поголовья животных.
По таким опасным заболеваниям как африканская чума, гриппу птиц и свиней за отчетный период в Башкортостане складывается благополучная обстановка.
В сфере ветеринарного надзора на Госгранице РФ и транспорте в 2019 году проведено 83 контрольно-надзорных мероприятия: 26 рейдов с участием прокуратуры и таможни по местам несанкционированной торговли подконтрольной продукцией, 57 – ветеринарно-санитарных обследований предприятий.
Досмотрено продукции животного происхождения и кормов всего 5739 партий – 250985 тонн, 3906 тыс. штук пищевого яйца; животные: племенной крупный рогатый скот 136 партий – 4500 голов; пользовательский КРС четыре партии – 231 голова; убойный КРС одна партия – 32 головы; семь партий – 587 голов племенных свиней; 1176 партий – 1270 голов домашних животных; 76 партий – 9,294 тыс. голов птицы; 93 партии – 38,24 тыс. штук живой рыбы; 14 партий – 2431 шт. пчелопакетов; шесть партий – 399,88 тыс. шт. инкубационного яйца. Племенной и генетический материал: 302 партии – 18325 доз спермы, 22 партии – 1,7 млнштук оплодотворенной икры.
При экспортно-импортных поставках подконтрольной продукции выдано 1405 международных ветеринарных сертификатов.
В воздушном пункте пропуска через Государственную границу в Международном аэропорту «Уфа» в ходе досмотра ручной клади и багажа пассажиров из Азербайджана, Таджикистана, Узбекистана, Грузии и Турции, выявлено 294 нарушения ветеринарно-санитарных правил перевозок животноводческих грузов – отсутствие ветеринарных сопроводительных документов. Изъято и утилизировано 665,3 кг продукции.
Совместно с Управлением ветеринарии Республики Башкортостан проведено 57 комиссионных обследований хозяйствующих субъектов, из них: 31 предприятие – на соблюдение ветеринарно-санитарных требований для включения в Реестр экспортеров и Реестр Таможенного союза в ФГИС «Цербер» и 26 – для получения разрешения на ввоз/вывоз племенного скота, племенного материала и инкубационного яйца. 
По результатам обследований 21 предприятие включено в Реестр экспортеров и Таможенного союза, 26 предприятий получили разрешение на ввоз сельскохозяйственных животных и птицы из третьих стран.
В целях предотвращения нелегальных поставок на территорию России продукции из третьих стран, согласно Указу Президента Российской Федерации от 06.08.2014 № 560 «О применении отдельных специальных экономических мер в целях обеспечения безопасности РФ» совместно с Башкортостанской таможней, Прокуратурой и Роспотребнадзором проверено 26 совместных рейдов оптовых баз по хранению и реализации продукции животного происхождения.
Выявлено 24,832 кг сыра производства Германии, Голландии и Швейцарии. Вся санкционная продукция изъята и уничтожена.
В сфере карантина растений проведено 727 контрольно-надзорных мероприятий. Возбуждено 285 административных дел, рассмотрено – 285, вынесено 272 постановления о наложении штрафа на сумму 298 тыс. 980 рублей, взыскано 100%. 
При осуществлении карантинного фитосанитарного контроля в пункте пропуска в Международном аэропорту «Уфа» выявлено 7 видов карантинных объектов (горчак ползучий, муха-горбатка, повилика, зерновка рода Callosobruchus spp, западный калифорнийский трипс, ценхрус длинноколючий, калифорнийская щитовка) в 9 случаях задержанная подкарантинная продукция изъята и уничтожена. 
При осуществлении фитосанитарного контроля досмотрено 10,3 тыс. тонны подкарантинной продукции, ввезенной из-за рубежа. По результатам надзора в системе «Аргус-Фито» оформлено 540 актов.
На экспорт отгружено 265,8 тыс. тонны, 140,8 тыс. куб. м подкарантинной продукции. При этом оформлено 9396 фитосанитарных сертификатов.
Проконтролировано подкарантинной продукции при ввозе и вывозе на территорию России в объеме 577,8 тыс. тонны, 1974,4 тыс. штуки и 867,9 тыс. куб. м. Оформлено 5310 карантинных сертификатов.
При осуществлении контроля выявлено свыше 1140 случаев зараженной и засоренной подкарантинной продукции; 27,4 тыс. тонны продукции с наличием карантинных объектов переработано по технологии, лишающей семена жизнеспособности.
Проведен мониторинг карантинного фитосанитарного состояния территории республики на выявление карантинных объектов по 41 виду на площади 230,226 тыс. га: в том числе 96637,3 га с применением феромонных ловушек. Всего при обследовании использовано 1236 феромонных ловушек. Подтверждены ранее выявленные очаги большого черного елового усача на площади 6200 га, малого черного елового усача на площади 1000 га и черного соснового усача на площади 19800 га.
По итогам проведенных обследований упразднены карантинные фитосанитарные зоны и отменены карантинные фитосанитарные режимы по повилике на площади 1239,1 га.
В целях предотвращения нелегальных поставок на территорию России продукции из третьих стран, согласно Указу Президента Российской Федерации от 06.08.2017 № 560 «О применении отдельных специальных экономических мер в целях обеспечения безопасности РФ» совместно с Башкортостанской таможней, Прокуратурой и Роспотребнадзором проверено 8 оптовых баз по хранению и реализации продукции растительного происхождения. В ходе 49 рейдов изъято и уничтожено 1124,85 кг санкционной продукции растительного происхождения: груши, виноград, яблоки, клубника.
В сфере обеспечения качества и безопасности зерна проведено 136 проверок. Выявлено 63 нарушения, составлено 63 протокола, выдано 23 предписания об устранении нарушений, вынесено 58 постановлений о привлечении к административной ответственности. Назначено штрафов на сумму 775 тысяч рублей, в пяти случаях вынесены предупреждения.
Проконтролировано 910,6 тыс. тонны зерна, при этом выявлено – 8,2 тыс. тонны зерна несоответствующего требованиям, прекращено действие 5 деклараций о соответствии на 11,3 тыс. тонны продовольственной продукции. 
В сфере семеноводства проведено 262 проверки, вынесено 117 постановлений, наложено административного штрафа на сумму 54 тыс. 600 рублей, взыскано 100%. 
В сфере семенного контроля в рамках государственного задания отобрано 203 пробы от 113 партий семян массой 3,1 тыс. тонны. По результатам лабораторных испытаний в 61 пробе (17,4%) от 29 партий выявлено несоответствие по показателям качества ранее выданных документов. 
В сфере государственного земельного надзора проведено 665 контрольно-надзорных мероприятий, обследовано 508,2 тыс. га, выявлено 296 нарушений земельного законодательства. 
В ходе проверок выявлены 33 несанкционированные свалки и 12 карьеров по добыче ОПИ общей площадью 34,01 га и 3,7 га соответственно.
По итогам контроля исполнения предписаний ликвидировано 15 свалок, рекультивировано 7 карьеров.
В службу судебных приставов направлены 22 материала для принудительного взыскания штрафов на сумму 1 млн 717 тыс. рублей.
Управлением Россельхознадзора по Республике Башкортостан нарушителям направлены 2 претензии и 2 иска по возмещению вреда, причиненного почве. Выдано 41 предостережение о недопустимости нарушений обязательных требований – по шести получены уведомления об исполнении. 
В отношении всех нарушителей Управлением применены меры административной ответственности и выданы предписания об устранении выявленных нарушений. В результате контрольно-надзорной деятельности в сельскохозяйственный оборот введено 162 га сельхозземель.